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.github/workflows/continuous.yml

@@ -44,16 +44,17 @@ jobs:
       - name: Dependencies (Linux)
         if: runner.os == 'Linux'
         run: |
+            sudo apt-get update
             sudo apt-get install \
-            libblas-dev \
-            libboost-filesystem-dev \
-            libboost-system-dev \
-            libboost-thread-dev \
-            libglu1-mesa-dev \
-            liblapack-dev \
-            libmpfr-dev \
-            xorg-dev \
-            ccache
+              libblas-dev \
+              libboost-filesystem-dev \
+              libboost-system-dev \
+              libboost-thread-dev \
+              libglu1-mesa-dev \
+              liblapack-dev \
+              libmpfr-dev \
+              xorg-dev \
+              ccache
 
       - name: Dependencies (macOS)
         if: runner.os == 'macOS'

cmake/LibiglDownloadExternal.cmake

@@ -51,7 +51,7 @@ endfunction()
 function(igl_download_comiso)
 	igl_download_project(CoMISo
 		GIT_REPOSITORY https://github.com/libigl/CoMISo.git
-		GIT_TAG        1f9618cf9b7bd77370d817976470d59091928606
+		GIT_TAG        d60aa4759fba76b0b793b1efb090b7a771dd7c56
 	)
 endfunction()
 

include/igl/AABB.cpp

@@ -1024,65 +1024,41 @@ namespace igl
 
 #ifdef IGL_STATIC_LIBRARY
 // Explicit template instantiation
-// generated by autoexplicit.sh
+template bool igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 3>::intersect_ray<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> const&, Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> const&, igl::Hit&) const;
+template double igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 2>::squared_distance<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::Matrix<double, 1, 2, 1, 1, 2> const&, int&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, 1, 2, 1, 1, 2> >&) const;
+template double igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 3>::squared_distance<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> const&, double, int&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> >&) const;
+template double igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 3>::squared_distance<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> const&, int&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> >&) const;
 template double igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 1, -1, 3>, 3>::squared_distance<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 1, -1, 3> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 1, -1, 3> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 1, -1, 3> > const&, Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> const&, double, double, int&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> >&) const;
-// generated by autoexplicit.sh
-template void igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 1, -1, 3>, 3>::init<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 1, -1, 3> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 1, -1, 3> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 1, -1, 3> > const&);
-// generated by autoexplicit.sh
-// generated by autoexplicit.sh
 template float igl::AABB<Eigen::Matrix<float, -1, 3, 0, -1, 3>, 3>::squared_distance<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 0, -1, 3> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<float, -1, 3, 0, -1, 3> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 0, -1, 3> > const&, Eigen::Matrix<float, 1, 3, 1, 1, 3> const&, float, float, int&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<float, 1, 3, 1, 1, 3> >&) const;
-// generated by autoexplicit.sh
-// generated by autoexplicit.sh
-template void igl::AABB<Eigen::Matrix<float, -1, 3, 0, -1, 3>, 3>::init<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 0, -1, 3> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<float, -1, 3, 0, -1, 3> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 0, -1, 3> > const&);
-// generated by autoexplicit.sh
-template void igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 3>::serialize<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, int) const;
-// generated by autoexplicit.sh
-template std::vector<int, std::allocator<int> > igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 3>::find<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, 1, -1, 1, 1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, 1, -1, 1, 1, -1> > const&, bool) const;
-// generated by autoexplicit.sh
-template void igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 2>::serialize<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, int) const;
-// generated by autoexplicit.sh
+template float igl::AABB<Eigen::Matrix<float, -1, 3, 1, -1, 3>, 3>::squared_distance<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 1, -1, 3> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<float, -1, 3, 1, -1, 3> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 1, -1, 3> > const&, Eigen::Matrix<float, 1, 3, 1, 1, 3> const&, int&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<float, 1, 3, 1, 1, 3> >&) const;
 template std::vector<int, std::allocator<int> > igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 2>::find<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, 1, -1, 1, 1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, 1, -1, 1, 1, -1> > const&, bool) const;
-// generated by autoexplicit.sh
-template void igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 3>::init<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, int);
-// generated by autoexplicit.sh
+template std::vector<int, std::allocator<int> > igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 3>::find<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Block<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> const, 1, -1, false> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Block<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> const, 1, -1, false> > const&, bool) const;
+template std::vector<int, std::allocator<int> > igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 3>::find<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, 1, -1, 1, 1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, 1, -1, 1, 1, -1> > const&, bool) const;
+template void igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 2>::init<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&);
 template void igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 2>::init<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, int);
-// generated by autoexplicit.sh
-template float igl::AABB<Eigen::Matrix<float, -1, 3, 1, -1, 3>, 3>::squared_distance<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 1, -1, 3> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<float, -1, 3, 1, -1, 3> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 1, -1, 3> > const&, Eigen::Matrix<float, 1, 3, 1, 1, 3> const&, int&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<float, 1, 3, 1, 1, 3> >&) const;
-// generated by autoexplicit.sh
-template void igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 3>::squared_distance<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&) const;
-// generated by autoexplicit.sh
-template void igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 3>::squared_distance<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> >&) const;
-// generated by autoexplicit.sh
-template void igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 3>::squared_distance<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&) const;
-// generated by autoexplicit.sh
-template double igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 3>::squared_distance<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> const&, int&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> >&) const;
-// generated by autoexplicit.sh
+template void igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 2>::init<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&);
+template void igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 2>::serialize<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, int) const;
 template void igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 2>::squared_distance<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&) const;
-// generated by autoexplicit.sh
-template void igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 2>::squared_distance<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> >&) const;
-// generated by autoexplicit.sh
+template void igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 2>::squared_distance<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&) const;
 template void igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 2>::squared_distance<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&) const;
-// generated by autoexplicit.sh
-template double igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 2>::squared_distance<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::Matrix<double, 1, 2, 1, 1, 2> const&, int&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, 1, 2, 1, 1, 2> >&) const;
-// generated by autoexplicit.sh
-template void igl::AABB<Eigen::Matrix<float, -1, 3, 1, -1, 3>, 3>::init<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 1, -1, 3> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<float, -1, 3, 1, -1, 3> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 1, -1, 3> > const&);
-// generated by autoexplicit.sh
+template void igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 2>::squared_distance<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> >&) const;
+template void igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 2>::squared_distance<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&) const;
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-// generated by autoexplicit.sh
-template void igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 2>::init<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&);
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-
-template void igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 2>::init<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&);
+template void igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 3>::init<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, int);
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-
-template void igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 2>::squared_distance<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&) const;
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+template void igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 3>::squared_distance<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, 2, 3, 0, 2, 3>, Eigen::Matrix<double, 2, 1, 0, 2, 1>, Eigen::Matrix<int, 2, 1, 0, 2, 1>, Eigen::Matrix<double, 2, 3, 0, 2, 3> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, 2, 3, 0, 2, 3> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, 2, 1, 0, 2, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, 2, 1, 0, 2, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, 2, 3, 0, 2, 3> >&) const;
 template void igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 3>::squared_distance<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&) const;
-template std::vector<int, std::allocator<int> > igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 3>::find<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Block<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> const, 1, -1, false> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Block<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> const, 1, -1, false> > const&, bool) const;
+template void igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 1, -1, 3>, 3>::init<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 1, -1, 3> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 1, -1, 3> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 1, -1, 3> > const&);
+template void igl::AABB<Eigen::Matrix<float, -1, 3, 0, -1, 3>, 3>::init<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 0, -1, 3> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<float, -1, 3, 0, -1, 3> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 0, -1, 3> > const&);
+template void igl::AABB<Eigen::Matrix<float, -1, 3, 1, -1, 3>, 3>::init<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 1, -1, 3> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<float, -1, 3, 1, -1, 3> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 1, -1, 3> > const&);
+template double igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 3>::squared_distance<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> const&, int&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> >&) const;
+template double igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 2>::squared_distance<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, Eigen::Matrix<double, 1, 2, 1, 1, 2> const&, int&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, 1, 2, 1, 1, 2> >&) const;
 #ifdef WIN32
 template void igl::AABB<class Eigen::Matrix<double,-1,-1,0,-1,-1>,2>::squared_distance<class Eigen::Matrix<int,-1,-1,0,-1,-1>,class Eigen::Matrix<double,-1,-1,0,-1,-1>,class Eigen::Matrix<double,-1,1,0,-1,1>,class Eigen::Matrix<__int64,-1,1,0,-1,1>,class Eigen::Matrix<double,-1,3,0,-1,3> >(class Eigen::MatrixBase<class Eigen::Matrix<double,-1,-1,0,-1,-1> > const &,class Eigen::MatrixBase<class Eigen::Matrix<int,-1,-1,0,-1,-1> > const &,class Eigen::MatrixBase<class Eigen::Matrix<double,-1,-1,0,-1,-1> > const &,class Eigen::PlainObjectBase<class Eigen::Matrix<double,-1,1,0,-1,1> > &,class Eigen::PlainObjectBase<class Eigen::Matrix<__int64,-1,1,0,-1,1> > &,class Eigen::PlainObjectBase<class Eigen::Matrix<double,-1,3,0,-1,3> > &)const;
 template void igl::AABB<class Eigen::Matrix<double,-1,-1,0,-1,-1>,3>::squared_distance<class Eigen::Matrix<int,-1,-1,0,-1,-1>,class Eigen::Matrix<double,-1,-1,0,-1,-1>,class Eigen::Matrix<double,-1,1,0,-1,1>,class Eigen::Matrix<__int64,-1,1,0,-1,1>,class Eigen::Matrix<double,-1,3,0,-1,3> >(class Eigen::MatrixBase<class Eigen::Matrix<double,-1,-1,0,-1,-1> > const &,class Eigen::MatrixBase<class Eigen::Matrix<int,-1,-1,0,-1,-1> > const &,class Eigen::MatrixBase<class Eigen::Matrix<double,-1,-1,0,-1,-1> > const &,class Eigen::PlainObjectBase<class Eigen::Matrix<double,-1,1,0,-1,1> > &,class Eigen::PlainObjectBase<class Eigen::Matrix<__int64,-1,1,0,-1,1> > &,class Eigen::PlainObjectBase<class Eigen::Matrix<double,-1,3,0,-1,3> > &)const;

include/igl/barycentric_to_global.cpp

@@ -1,44 +0,0 @@
-// This file is part of libigl, a simple c++ geometry processing library.
-//
-// Copyright (C) 2013 Daniele Panozzo <[email protected]>
-//
-// This Source Code Form is subject to the terms of the Mozilla Public License
-// v. 2.0. If a copy of the MPL was not distributed with this file, You can
-// obtain one at http://mozilla.org/MPL/2.0/.
-#include "barycentric_to_global.h"
-
-// For error printing
-#include <cstdio>
-#include <vector>
-
-namespace igl
-{
-  template <typename Scalar, typename Index>
-  IGL_INLINE Eigen::Matrix<Scalar,Eigen::Dynamic,Eigen::Dynamic> barycentric_to_global(
-    const Eigen::Matrix<Scalar,Eigen::Dynamic,Eigen::Dynamic> & V,
-    const Eigen::Matrix<Index,Eigen::Dynamic,Eigen::Dynamic>  & F,
-    const Eigen::Matrix<Scalar,Eigen::Dynamic,Eigen::Dynamic> & bc)
-  {
-    Eigen::Matrix<Scalar,Eigen::Dynamic,Eigen::Dynamic> R;
-    R.resize(bc.rows(),3);
-
-    for (unsigned i=0; i<R.rows(); ++i)
-    {
-      unsigned id = round(bc(i,0));
-      double u   = bc(i,1);
-      double v   = bc(i,2);
-
-      if (id != -1)
-        R.row(i) = V.row(F(id,0)) +
-                  ((V.row(F(id,1)) - V.row(F(id,0))) * u +
-                   (V.row(F(id,2)) - V.row(F(id,0))) * v  );
-      else
-        R.row(i) << 0,0,0;
-    }
-    return R;
-  }
-}
-
-#ifdef IGL_STATIC_LIBRARY
-template Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> igl::barycentric_to_global<double, int>(Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> const&, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> const&, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> const&);
-#endif

include/igl/barycentric_to_global.h

@@ -1,42 +0,0 @@
-// This file is part of libigl, a simple c++ geometry processing library.
-// 
-// Copyright (C) 2013 Daniele Panozzo <[email protected]>
-// 
-// This Source Code Form is subject to the terms of the Mozilla Public License 
-// v. 2.0. If a copy of the MPL was not distributed with this file, You can 
-// obtain one at http://mozilla.org/MPL/2.0/.
-#ifndef IGL_BARYCENTRIC2GLOBAL_H
-#define IGL_BARYCENTRIC2GLOBAL_H
-#include <igl/igl_inline.h>
-
-#include <Eigen/Dense>
-#include <Eigen/Sparse>
-
-namespace igl 
-{
-  // Converts barycentric coordinates in the embree form to 3D coordinates
-  // Embree stores barycentric coordinates as triples: fid, bc1, bc2
-  // fid is the id of a face, bc1 is the displacement of the point wrt the 
-  // first vertex v0 and the edge v1-v0. Similarly, bc2 is the displacement
-  // wrt v2-v0.
-  // 
-  // Input:
-  // V:  #Vx3 Vertices of the mesh
-  // F:  #Fxe Faces of the mesh
-  // bc: #Xx3 Barycentric coordinates, one row per point
-  //
-  // Output:
-  // #X: #Xx3 3D coordinates of all points in bc
-  template <typename Scalar, typename Index>
-  IGL_INLINE Eigen::Matrix<Scalar,Eigen::Dynamic,Eigen::Dynamic> 
-    barycentric_to_global(
-      const Eigen::Matrix<Scalar,Eigen::Dynamic,Eigen::Dynamic> & V, 
-      const Eigen::Matrix<Index,Eigen::Dynamic,Eigen::Dynamic>   & F, 
-      const Eigen::Matrix<Scalar,Eigen::Dynamic,Eigen::Dynamic>  & bc);
-}
-
-#ifndef IGL_STATIC_LIBRARY
-#  include "barycentric_to_global.cpp"
-#endif
-
-#endif

include/igl/copyleft/cgal/minkowski_sum.cpp

@@ -382,6 +382,8 @@ IGL_INLINE void igl::copyleft::cgal::minkowski_sum(
 #ifdef IGL_STATIC_LIBRARY
 // Explicit template instantiation
 // generated by autoexplicit.sh
+template void igl::copyleft::cgal::minkowski_sum<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, double, 3, 1, double, 3, 1, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> const&, Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> const&, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
+// generated by autoexplicit.sh
 template void igl::copyleft::cgal::minkowski_sum<Eigen::Matrix<CGAL::Lazy_exact_nt<CGAL::Gmpq>, -1, -1, 1, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 3, 1, -1, 3>, CGAL::Lazy_exact_nt<CGAL::Gmpq>, 3, 1, CGAL::Lazy_exact_nt<CGAL::Gmpq>, 3, 1, Eigen::Matrix<CGAL::Lazy_exact_nt<CGAL::Gmpq>, -1, -1, 1, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<CGAL::Lazy_exact_nt<CGAL::Gmpq>, -1, -1, 1, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 1, -1, 3> > const&, Eigen::Matrix<CGAL::Lazy_exact_nt<CGAL::Gmpq>, 1, 3, 1, 1, 3> const&, Eigen::Matrix<CGAL::Lazy_exact_nt<CGAL::Gmpq>, 1, 3, 1, 1, 3> const&, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<CGAL::Lazy_exact_nt<CGAL::Gmpq>, -1, -1, 1, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
 // generated by autoexplicit.sh
 template void igl::copyleft::cgal::minkowski_sum<

include/igl/knn.cpp

@@ -1,88 +1,120 @@
 #include "knn.h"
+#include "sort.h"
 #include "parallel_for.h"
 
 #include <cmath>
 #include <queue>
+#include <set>
+#include <algorithm>
 
 namespace igl {
-  template <typename DerivedP, typename KType, typename IndexType,
+  template <typename DerivedP, typename IndexType,
   typename DerivedCH, typename DerivedCN, typename DerivedW,
   typename DerivedI>
   IGL_INLINE void knn(const Eigen::MatrixBase<DerivedP>& P,
-                      const KType & k,
+                      size_t k,
                       const std::vector<std::vector<IndexType> > & point_indices,
                       const Eigen::MatrixBase<DerivedCH>& CH,
                       const Eigen::MatrixBase<DerivedCN>& CN,
                       const Eigen::MatrixBase<DerivedW>& W,
-                      Eigen::PlainObjectBase<DerivedI> & I)
-  {
+                      Eigen::PlainObjectBase<DerivedI> & I) {
+      knn(P,P,k,point_indices,CH,CN,W,I);
+  }
+
+  template <typename DerivedP, typename DerivedV, typename IndexType,
+  typename DerivedCH, typename DerivedCN, typename DerivedW,
+  typename DerivedI>
+      IGL_INLINE void knn(
+              const Eigen::MatrixBase<DerivedP>& P,
+              const Eigen::MatrixBase<DerivedV>& V,
+              size_t k,
+              const std::vector<std::vector<IndexType> > & point_indices,
+              const Eigen::MatrixBase<DerivedCH>& CH,
+              const Eigen::MatrixBase<DerivedCN>& CN,
+              const Eigen::MatrixBase<DerivedW>& W,
+              Eigen::PlainObjectBase<DerivedI> & I) {
     typedef typename DerivedCN::Scalar CentersType;
     typedef typename DerivedW::Scalar WidthsType;
-    
-    typedef Eigen::Matrix<typename DerivedP::Scalar, 1, 3> RowVector3PType;
-    
-    int n = P.rows();
-    const KType real_k = std::min(n,k);
-    
-    auto distance_to_width_one_cube = [](RowVector3PType point){
-      return std::sqrt(std::pow(std::max(std::abs(point(0))-1,0.0),2)
-                       + std::pow(std::max(std::abs(point(1))-1,0.0),2)
-                       + std::pow(std::max(std::abs(point(2))-1,0.0),2));
+
+    using Scalar = typename DerivedP::Scalar;
+    typedef Eigen::Matrix<Scalar, 1, 3> RowVector3PType;
+
+
+    const size_t Psize = P.rows();
+    const size_t Vsize = V.rows();
+    if(Vsize <= k) {
+        I.resize(Psize,Vsize);
+        for(size_t i = 0; i < Psize; ++i) {
+            Eigen::Matrix<Scalar,Eigen::Dynamic,1> D = (V.rowwise() - P.row(i)).rowwise().norm();
+            Eigen::Matrix<Scalar,Eigen::Dynamic,1> S;
+            Eigen::VectorXi R;
+            igl::sort(D,1,true,S,R);
+            I.row(i) = R.transpose();
+        }
+        return;
+    }
+
+    I.resize(Psize,k);
+
+
+    auto distance_to_width_one_cube = [](const RowVector3PType& point) -> Scalar {
+      return std::sqrt(std::pow<Scalar>(std::max<Scalar>(std::abs(point(0))-1,0.0),2)
+                       + std::pow<Scalar>(std::max<Scalar>(std::abs(point(1))-1,0.0),2)
+                       + std::pow<Scalar>(std::max<Scalar>(std::abs(point(2))-1,0.0),2));
     };
-    
+
     auto distance_to_cube = [&distance_to_width_one_cube]
-              (RowVector3PType point,
+              (const RowVector3PType& point,
                Eigen::Matrix<CentersType,1,3> cube_center,
-               WidthsType cube_width){
+               WidthsType cube_width) -> Scalar {
       RowVector3PType transformed_point = (point-cube_center)/cube_width;
       return cube_width*distance_to_width_one_cube(transformed_point);
     };
-    
-    I.resize(n,real_k);
-    
-    igl::parallel_for(n,[&](int i)
+
+
+    igl::parallel_for(Psize,[&](size_t i)
     {
       int points_found = 0;
       RowVector3PType point_of_interest = P.row(i);
-      
+
       //To make my priority queue take both points and octree cells,
       //I use the indices 0 to n-1 for the n points,
       // and the indices n to n+m-1 for the m octree cells
-      
+
       // Using lambda to compare elements.
-      auto cmp = [&point_of_interest, &P, &CN, &W,
-                  &n, &distance_to_cube](int left, int right) {
-        double leftdistance, rightdistance;
-        if(left < n){ //left is a point index
-          leftdistance = (P.row(left) - point_of_interest).norm();
+      auto cmp = [&point_of_interest, &V, &CN, &W,
+                  Vsize, &distance_to_cube](int left, int right) {
+        Scalar leftdistance, rightdistance;
+        if(left < Vsize){ //left is a point index
+          leftdistance = (V.row(left) - point_of_interest).norm();
         } else { //left is an octree cell
           leftdistance = distance_to_cube(point_of_interest,
-                                            CN.row(left-n),
-                                            W(left-n));
+                                            CN.row(left-Vsize),
+                                            W(left-Vsize));
         }
-      
-        if(right < n){ //left is a point index
-          rightdistance = (P.row(right) - point_of_interest).norm();
+
+        if(right < Vsize){ //left is a point index
+          rightdistance = (V.row(right) - point_of_interest).norm();
         } else { //left is an octree cell
           rightdistance = distance_to_cube(point_of_interest,
-                                             CN.row(right-n),
-                                             W(right-n));
+                                             CN.row(right-Vsize),
+                                             W(right-Vsize));
         }
         return leftdistance > rightdistance;
       };
-      
+
       std::priority_queue<IndexType, std::vector<IndexType>,
         decltype(cmp)> queue(cmp);
-      
-      queue.push(n); //This is the 0th octree cell (ie the root)
-      while(points_found < real_k){
+
+      queue.push(Vsize); //This is the 0th octree cell (ie the root)
+      while(points_found < k){
         IndexType curr_cell_or_point = queue.top();
         queue.pop();
-        if(curr_cell_or_point < n){ //current index is for is a point
+        if(curr_cell_or_point < Vsize){ //current index is for is a point
           I(i,points_found) = curr_cell_or_point;
           points_found++;
         } else {
-          IndexType curr_cell = curr_cell_or_point - n;
+          IndexType curr_cell = curr_cell_or_point - Vsize;
           if(CH(curr_cell,0) == -1){ //In the case of a leaf
             if(point_indices.at(curr_cell).size() > 0){
               //Assumption: Leaves either have one point, or none
@@ -91,7 +123,7 @@ namespace igl {
           } else { //Not a leaf
             for(int j = 0; j < 8; j++){
               //+n to adjust for the octree cells
-              queue.push(CH(curr_cell,j)+n);
+              queue.push(CH(curr_cell,j)+Vsize);
             }
           }
         }
@@ -105,6 +137,12 @@ namespace igl {
 #ifdef IGL_STATIC_LIBRARY
 // Explicit template instantiation
 // generated by autoexplicit.sh
-template void igl::knn<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, int, int, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, int const&, std::vector<std::vector<int, std::allocator<int> >, std::allocator<std::vector<int, std::allocator<int> > > > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
-template void igl::knn<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, int, int, Eigen::Matrix<int, -1, 8, 0, -1, 8>, Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3>, Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, int const&, std::vector<std::vector<int, std::allocator<int> >, std::allocator<std::vector<int, std::allocator<int> > > > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, 8, 0, -1, 8> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
+
+template void igl::knn<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, int, Eigen::Matrix<int, -1, 8, 0, -1, 8>, Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3>, Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, unsigned long, std::vector<std::vector<int, std::allocator<int> >, std::allocator<std::vector<int, std::allocator<int> > > > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, 8, 0, -1, 8> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
+template void igl::knn<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, int, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, unsigned long, std::vector<std::vector<int, std::allocator<int> >, std::allocator<std::vector<int, std::allocator<int> > > > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
+#ifdef WIN32
+template void igl::knn<Eigen::Matrix<double,-1,-1,0,-1,-1>,int,Eigen::Matrix<int,-1,-1,0,-1,-1>,Eigen::Matrix<double,-1,-1,0,-1,-1>,Eigen::Matrix<double,-1,1,0,-1,1>,Eigen::Matrix<int,-1,-1,0,-1,-1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double,-1,-1,0,-1,-1> > const &,unsigned __int64,std::vector<std::vector<int,std::allocator<int> >,std::allocator<std::vector<int,std::allocator<int> > > > const &,Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int,-1,-1,0,-1,-1> > const &,Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double,-1,-1,0,-1,-1> > const &,Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double,-1,1,0,-1,1> > const &,Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int,-1,-1,0,-1,-1> > &);
+template void igl::knn<Eigen::Matrix<double,-1,-1,0,-1,-1>,Eigen::Matrix<double,-1,-1,0,-1,-1>,int,Eigen::Matrix<int,-1,8,0,-1,8>,Eigen::Matrix<double,-1,3,0,-1,3>,Eigen::Matrix<double,-1,1,0,-1,1>,Eigen::Matrix<int,-1,-1,0,-1,-1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double,-1,-1,0,-1,-1> > const &,Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double,-1,-1,0,-1,-1> > const &,unsigned __int64,std::vector<std::vector<int,std::allocator<int> >,std::allocator<std::vector<int,std::allocator<int> > > > const &,Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int,-1,8,0,-1,8> > const &,Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double,-1,3,0,-1,3> > const &,Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double,-1,1,0,-1,1> > const &,Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int,-1,-1,0,-1,-1> > &);
+#endif
+
 #endif

include/igl/knn.h

@@ -36,15 +36,45 @@ namespace igl
   //   I  #P by k list of k-nearest-neighbor indices into P
   template <
     typename DerivedP, 
-    typename KType, 
     typename IndexType,
-    typename DerivedCH, 
-    typename DerivedCN, 
+    typename DerivedCH,
+    typename DerivedCN,
     typename DerivedW,
     typename DerivedI>
   IGL_INLINE void knn(
     const Eigen::MatrixBase<DerivedP>& P,
-    const KType & k,
+    size_t k,
+    const std::vector<std::vector<IndexType> > & point_indices,
+    const Eigen::MatrixBase<DerivedCH>& CH,
+    const Eigen::MatrixBase<DerivedCN>& CN,
+    const Eigen::MatrixBase<DerivedW>& W,
+    Eigen::PlainObjectBase<DerivedI> & I);
+  // Inputs:
+  //   P  #P by 3 list of point locations for which which we want the neighbors of
+  //   V  #V by 3 list of point locations for which may be neighbors 
+  //   k  number of neighbors to find
+  //   point_indices  a vector of vectors, where the ith entry is a vector of
+  //                  the indices into P that are the ith octree cell's points
+  //   CH     #OctreeCells by 8, where the ith row is the indices of
+  //          the ith octree cell's children
+  //   CN     #OctreeCells by 3, where the ith row is a 3d row vector
+  //          representing the position of the ith cell's center
+  //   W      #OctreeCells, a vector where the ith entry is the width
+  //          of the ith octree cell
+  // Outputs:
+  //   I  #P by k list of k-nearest-neighbor indices into V
+  template <
+    typename DerivedP, 
+    typename DerivedV,
+    typename IndexType,
+    typename DerivedCH,
+    typename DerivedCN,
+    typename DerivedW,
+    typename DerivedI>
+  IGL_INLINE void knn(
+    const Eigen::MatrixBase<DerivedP>& P,
+    const Eigen::MatrixBase<DerivedV>& V,
+    size_t k,
     const std::vector<std::vector<IndexType> > & point_indices,
     const Eigen::MatrixBase<DerivedCH>& CH,
     const Eigen::MatrixBase<DerivedCN>& CN,
@@ -55,4 +85,4 @@ namespace igl
 #  include "knn.cpp"
 #endif
 #endif
-
+

include/igl/octree.cpp

@@ -19,8 +19,9 @@ namespace igl {
     typedef typename DerivedCH::Scalar ChildrenType;
     typedef typename DerivedCN::Scalar CentersType;
     typedef typename DerivedW::Scalar WidthsType;
+    typedef typename DerivedP::Scalar PointScalar;
     typedef Eigen::Matrix<ChildrenType,8,1> Vector8i;
-    typedef Eigen::Matrix<typename DerivedP::Scalar, 1, 3> RowVector3PType;
+    typedef Eigen::Matrix<PointScalar, 1, 3> RowVector3PType;
     typedef Eigen::Matrix<CentersType, 1, 3>       RowVector3CentersType;
     
     std::vector<Eigen::Matrix<ChildrenType,8,1>,
@@ -29,8 +30,8 @@ namespace igl {
         Eigen::aligned_allocator<Eigen::Matrix<CentersType,1,3> > > centers;
     std::vector<WidthsType> widths;
     
-    auto get_octant = [](RowVector3PType location,
-                         RowVector3CentersType center){
+    auto get_octant = [](const RowVector3PType& location,
+                         const RowVector3CentersType& center){
       // We use a binary numbering of children. Treating the parent cell's
       // center as the origin, we number the octants in the following manner:
       // The first bit is 1 iff the octant's x coordinate is positive
@@ -85,7 +86,7 @@ namespace igl {
   
     // Useful list of number 0..7
     const Vector8i zero_to_seven = (Vector8i()<<0,1,2,3,4,5,6,7).finished();
-    const Vector8i neg_ones = (Vector8i()<<-1,-1,-1,-1,-1,-1,-1,-1).finished();
+    const Vector8i neg_ones = Vector8i::Constant(-1);
   
     std::function< void(const ChildrenType, const int) > helper;
     helper = [&helper,&translate_center,&get_octant,&m,
@@ -138,17 +139,10 @@ namespace igl {
     children.emplace_back(neg_ones);
   
     //Get the minimum AABB for the points
-    RowVector3PType backleftbottom(P.col(0).minCoeff(),
-                                   P.col(1).minCoeff(),
-                                   P.col(2).minCoeff());
-    RowVector3PType frontrighttop(P.col(0).maxCoeff(),
-                                  P.col(1).maxCoeff(),
-                                  P.col(2).maxCoeff());
-    RowVector3CentersType aabb_center = (backleftbottom+frontrighttop)/2.0;
-    WidthsType aabb_width = std::max(std::max(
-                                          frontrighttop(0) - backleftbottom(0),
-                                          frontrighttop(1) - backleftbottom(1)),
-                                          frontrighttop(2) - backleftbottom(2));
+    RowVector3PType backleftbottom = P.colwise().minCoeff();
+    RowVector3PType frontrighttop = P.colwise().maxCoeff();
+    RowVector3CentersType aabb_center = (backleftbottom+frontrighttop)/PointScalar(2.0);
+    WidthsType aabb_width = (frontrighttop - backleftbottom).maxCoeff();
     centers.emplace_back( aabb_center );
   
     //Widths are the side length of the cube, (not half the side length):

include/igl/remove_duplicate_vertices.cpp

@@ -27,7 +27,7 @@ IGL_INLINE void igl::remove_duplicate_vertices(
   if(epsilon > 0)
   {
     DerivedV rV,rSV;
-    round((V/(10.0*epsilon)).eval(),rV);
+    round((V/(epsilon)).eval(),rV);
     unique_rows(rV,rSV,SVI,SVJ);
     slice(V,SVI,colon<typename DerivedSVI::Scalar>(0,V.cols()-1),SV);
   }else

include/igl/remove_duplicate_vertices.h

@@ -16,8 +16,8 @@ namespace igl
   //
   // Inputs:
   //   V  #V by dim list of vertex positions
-  //   epsilon  uniqueness tolerance (significant digit), can probably think of
-  //     this as a tolerance on L1 distance
+  //   epsilon  uniqueness tolerance used coordinate-wise: 1e0 --> integer
+  //     match, 1e-1 --> match up to first decimal, ... , 0 --> exact match.
   // Outputs:
   //   SV  #SV by dim new list of vertex positions
   //   SVI #SV by 1 list of indices so SV = V(SVI,:) 

include/igl/remove_duplicates.cpp

@@ -1,88 +0,0 @@
-// This file is part of libigl, a simple c++ geometry processing library.
-// 
-// Copyright (C) 2013 Alec Jacobson <[email protected]>
-// 
-// This Source Code Form is subject to the terms of the Mozilla Public License 
-// v. 2.0. If a copy of the MPL was not distributed with this file, You can 
-// obtain one at http://mozilla.org/MPL/2.0/.
-#include "remove_duplicates.h"
-#include <vector>
-
-//template <typename T, typename S>
-//IGL_INLINE void igl::remove_duplicates(
-//                                 const Eigen::Matrix<T, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic> &V,
-//                                 const Eigen::Matrix<S, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic> &F,
-//                                 Eigen::Matrix<T, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic> &NV,
-//                                 Eigen::Matrix<S, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic> &NF,
-//                                 Eigen::Matrix<S, Eigen::Dynamic, 1> &I,
-//                                 const double epsilon)
-template <typename DerivedV, typename DerivedF>
-IGL_INLINE void igl::remove_duplicates(
-  const Eigen::MatrixBase<DerivedV> &V,
-  const Eigen::MatrixBase<DerivedF> &F,
-  Eigen::PlainObjectBase<DerivedV> &NV,
-  Eigen::PlainObjectBase<DerivedF> &NF,
-  Eigen::Matrix<typename DerivedF::Scalar, Eigen::Dynamic, 1> &I,
-  const double epsilon)
-{
-  using namespace std;
-  //// build collapse map
-  int n = V.rows();
-  
-  I = Eigen::Matrix<typename DerivedF::Scalar, Eigen::Dynamic, 1>(n);
-  I[0] = 0;
-  
-  bool *VISITED = new bool[n];
-  for (int i =0; i <n; ++i)
-    VISITED[i] = false;
-  
-  NV.resize(n,V.cols());
-  int count = 0;
-  Eigen::VectorXd d(n);
-  for (int i =0; i <n; ++i)
-  {
-    if(!VISITED[i])
-    {
-      NV.row(count) = V.row(i);
-      I[i] = count;
-      VISITED[i] = true;
-      for (int j = i+1; j <n; ++j)
-      {
-        if((V.row(j) - V.row(i)).norm() < epsilon)
-        {
-          VISITED[j] = true;
-          I[j] = count;
-        }
-      }
-      count ++;
-    }
-  }
-  
-  NV.conservativeResize  (  count , Eigen::NoChange );
-
-  count = 0;
-  std::vector<typename DerivedF::Scalar> face;
-  NF.resizeLike(F);
-  for (int i =0; i <F.rows(); ++i)
-  {
-    face.clear();
-    for (int j = 0; j< F.cols(); ++j)
-      if(std::find(face.begin(), face.end(), I[F(i,j)]) == face.end())
-         face.push_back(I[F(i,j)]);
-    if (face.size() == size_t(F.cols()))
-    {
-      for (unsigned j = 0; j< F.cols(); ++j)
-        NF(count,j) = face[j];
-      count ++;
-    }
-  }
-  NF.conservativeResize  (  count , Eigen::NoChange );
-  
-  delete [] VISITED;
-}
-
-#ifdef IGL_STATIC_LIBRARY
-// Explicit template instantiation
-template void igl::remove_duplicates<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::Matrix<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>::Scalar, -1, 1, 0, -1, 1>&, double);
-template void igl::remove_duplicates<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 1, -1, 3>, Eigen::Matrix<int, -1, 3, 1, -1, 3> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 1, -1, 3> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 1, -1, 3> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 1, -1, 3> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 1, -1, 3> >&, Eigen::Matrix<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 1, -1, 3>::Scalar, -1, 1, 0, -1, 1>&, double);
-#endif

include/igl/remove_duplicates.h

@@ -1,50 +0,0 @@
-// This file is part of libigl, a simple c++ geometry processing library.
-// 
-// Copyright (C) 2013 Alec Jacobson <[email protected]>
-// 
-// This Source Code Form is subject to the terms of the Mozilla Public License 
-// v. 2.0. If a copy of the MPL was not distributed with this file, You can 
-// obtain one at http://mozilla.org/MPL/2.0/.
-#ifndef IGL_REMOVE_DUPLICATES_H
-#define IGL_REMOVE_DUPLICATES_H
-#include "igl_inline.h"
-#include "deprecated.h"
-
-#include <Eigen/Core>
-namespace igl 
-{
-  // [ NV, NF ] = remove_duplicates( V,F,epsilon )
-  // Merge the duplicate vertices from V, fixing the topology accordingly
-  //
-  // Input:
-  // V,F: mesh description
-  // epsilon: minimal distance to consider two vertices identical
-  //
-  // Output:
-  // NV, NF: new mesh without duplicate vertices
-  
-//  template <typename T, typename S>
-//  IGL_INLINE void remove_duplicates(
-//                                   const Eigen::Matrix<T, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic> &V,
-//                                   const Eigen::Matrix<S, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic> &F,
-//                                   Eigen::Matrix<T, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic> &NV,
-//                                   Eigen::Matrix<S, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic> &NF,
-//                                   Eigen::Matrix<S, Eigen::Dynamic, 1> &I,
-//                                   const double epsilon = 2.2204e-15);
-  
-  template <typename DerivedV, typename DerivedF>
-  IGL_DEPRECATED IGL_INLINE void remove_duplicates(
-    const Eigen::MatrixBase<DerivedV> &V,
-    const Eigen::MatrixBase<DerivedF> &F,
-    Eigen::PlainObjectBase<DerivedV> &NV,
-    Eigen::PlainObjectBase<DerivedF> &NF,
-    Eigen::Matrix<typename DerivedF::Scalar, Eigen::Dynamic, 1> &I,
-    const double epsilon = 2.2204e-15);
-  
-}
-
-#ifndef IGL_STATIC_LIBRARY
-#  include "remove_duplicates.cpp"
-#endif
-
-#endif

include/igl/slice.cpp

@@ -188,18 +188,10 @@ IGL_INLINE DerivedX igl::slice(
 
 #ifdef IGL_STATIC_LIBRARY
 // Explicit template instantiation
-// generated by autoexplicit.sh
-template void igl::slice<Eigen::Matrix<float, -1, 3, 1, -1, 3>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<float, -1, 3, 1, -1, 3> >(Eigen::Matrix<float, -1, 3, 1, -1, 3> const&, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, int, Eigen::Matrix<float, -1, 3, 1, -1, 3>&);
-// generated by autoexplicit.sh
-template void igl::slice<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 1, -1, 3>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<double, -1, 3, 1, -1, 3> >(Eigen::Matrix<double, -1, 3, 1, -1, 3> const&, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, int, Eigen::Matrix<double, -1, 3, 1, -1, 3>&);
-// generated by autoexplicit.sh
-template void igl::slice<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1> const&, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, int, Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1>&);
-// generated by autoexplicit.sh
-template void igl::slice<Eigen::Array<bool, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Array<bool, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::Array<bool, -1, 1, 0, -1, 1> const&, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, int, Eigen::Array<bool, -1, 1, 0, -1, 1>&);
-template void igl::slice<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> > const&, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> >&);
-template void igl::slice<Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, int, Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3>&);
 template Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> igl::slice<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>>(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>> const &, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>> const &, int);
 template Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> igl::slice<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>>(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>> const &, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>> const &);
+template Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> igl::slice<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, int);
+template void igl::slice<Eigen::Array<bool, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Array<bool, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::Array<bool, -1, 1, 0, -1, 1> const&, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, int, Eigen::Array<bool, -1, 1, 0, -1, 1>&);
 template void igl::slice<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>>(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>> const &, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>> const &, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>> &);
 template void igl::slice<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>>(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>> const &, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>> const &, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>> const &, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>> &);
 template void igl::slice<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>>(Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> const &, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>> const &, int, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> &);
@@ -207,11 +199,15 @@ template void igl::slice<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix
 template void igl::slice<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>>>(Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> const &, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>> const &, int, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>> &);
 template void igl::slice<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 1, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 1, -1, -1>>(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 1, -1, -1>> const &, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>> const &, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>> const &, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 1, -1, -1>> &);
 template void igl::slice<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>>(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1>> const &, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>> const &, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1>> &);
+template void igl::slice<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1> const&, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, int, Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1>&);
+template void igl::slice<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> > const&, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> >&);
 template void igl::slice<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 1, -1, 3>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>>(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 1, -1, 3>> const &, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>> const &, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>> const &, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>> &);
+template void igl::slice<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 1, -1, 3>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<double, -1, 3, 1, -1, 3> >(Eigen::Matrix<double, -1, 3, 1, -1, 3> const&, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, int, Eigen::Matrix<double, -1, 3, 1, -1, 3>&);
 template void igl::slice<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 1, -1, 3>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<double, -1, 3, 1, -1, 3>>(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 1, -1, 3>> const &, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>> const &, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>> const &, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 1, -1, 3>> &);
 template void igl::slice<Eigen::Matrix<float, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<float, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>>(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<float, -1, 1, 0, -1, 1>> const &, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>> const &, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<float, -1, 1, 0, -1, 1>> &);
 template void igl::slice<Eigen::Matrix<float, -1, 3, 0, -1, 3>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<float, -1, -1, 0, -1, -1>>(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<float, -1, 3, 0, -1, 3>> const &, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>> const &, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>> const &, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<float, -1, -1, 0, -1, -1>> &);
 template void igl::slice<Eigen::Matrix<float, -1, 3, 1, -1, 3>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<float, -1, -1, 0, -1, -1>>(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<float, -1, 3, 1, -1, 3>> const &, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>> const &, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>> const &, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<float, -1, -1, 0, -1, -1>> &);
+template void igl::slice<Eigen::Matrix<float, -1, 3, 1, -1, 3>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<float, -1, 3, 1, -1, 3> >(Eigen::Matrix<float, -1, 3, 1, -1, 3> const&, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, int, Eigen::Matrix<float, -1, 3, 1, -1, 3>&);
 template void igl::slice<Eigen::Matrix<float, -1, 3, 1, -1, 3>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<float, -1, 3, 1, -1, 3>>(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<float, -1, 3, 1, -1, 3>> const &, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>> const &, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>> const &, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<float, -1, 3, 1, -1, 3>> &);
 template void igl::slice<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>>>(Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> const &, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>> const &, int, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>> &);
 template void igl::slice<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Block<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> const, -1, 1, true>>(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>> const &, Eigen::DenseBase<Eigen::Block<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> const, -1, 1, true>> const &, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>> &);
@@ -237,6 +233,7 @@ template void igl::slice<Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>
 template void igl::slice<Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, int, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
 template void igl::slice<Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >, Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, int, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
 template void igl::slice<Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 1, -1, 3> >, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 1, -1, 3> > >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 1, -1, 3> > const&, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, int, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 1, -1, 3> >&);
+template void igl::slice<Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, int, Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3>&);
 template void igl::slice<Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>>>(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>> const &, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>> const &, int, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>> &);
 template void igl::slice<Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>>>(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>> const &, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>> const &, int, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>> &);
 template void igl::slice<Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>>, Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>>>(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>> const &, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1>> const &, int, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>> &);

include/igl/slice_mask.cpp

@@ -150,6 +150,8 @@ IGL_INLINE void igl::slice_mask(
 #ifdef IGL_STATIC_LIBRARY
 // Explicit template instantiation
 // generated by autoexplicit.sh
+template Eigen::Array<int, -1, -1, 0, -1, -1> igl::slice_mask<Eigen::Array<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Array<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::Array<bool, -1, 1, 0, -1, 1> const&, int);
+// generated by autoexplicit.sh
 template Eigen::Matrix<int, -1, 3, 1, -1, 3> igl::slice_mask<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 1, -1, 3> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 1, -1, 3> > const&, Eigen::Array<bool, -1, 1, 0, -1, 1> const&, int);
 // generated by autoexplicit.sh
 template Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> igl::slice_mask<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, Eigen::Array<bool, -1, 1, 0, -1, 1> const&, int);

tests/include/igl/knn.cpp

@@ -0,0 +1,78 @@
+#include <test_common.h>
+#include <igl/list_to_matrix.h>
+#include <igl/knn.h>
+#include <igl/octree.h>
+
+
+
+TEST_CASE("knn", "[igl]")
+{
+
+    auto run_knn = [](int k, const Eigen::MatrixXd & P, const Eigen::MatrixXd& V, typename Eigen::MatrixXi& I) {
+        std::vector<std::vector<int> > point_indices;
+        Eigen::Matrix<int,Eigen::Dynamic,8> CH;
+        Eigen::Matrix<double,Eigen::Dynamic,3> CN;
+        Eigen::Matrix<double,Eigen::Dynamic,1> W;
+        Eigen::Matrix<double,Eigen::Dynamic,1> A;
+
+        igl::octree(V,point_indices,CH,CN,W);
+
+        igl::knn(P,V,k,point_indices,CH,CN,W,I);
+    };
+    Eigen::Matrix<double,Eigen::Dynamic,3> V;
+    Eigen::Matrix<double,Eigen::Dynamic,3> P;
+    Eigen::MatrixXi I;
+    Eigen::MatrixXi answer;
+    {
+        //Test some simple points off a unit cube
+        V.resize(8,3);
+        V << 
+            0,0,1,
+            0,1,0,
+            0,1,1,
+            0,0,0,
+            1,0,0,
+            1,1,0,
+            1,1,1,
+            1,0,1;
+
+        P.resize(3,3);
+
+        P << 
+            0 ,0 ,0.6,
+              0.3 ,0.1 ,0.2,
+              .7,.6,0;
+
+
+        answer.resize(3,3);
+        answer << 0,3,2,
+               3,4,0,
+               5,4,1;
+        run_knn(3,P,V,I);
+        REQUIRE (I == answer);
+
+    }
+    {
+        //Test whether the kdtree works when passed things of different size
+
+        V.resize(2,3);
+        V << 0,0,0,
+          1,1,1;
+
+        P << 0,0,0,
+            -1,-1,-1,
+            2,2,2;
+
+        run_knn(10,P,V,I);
+        answer.resize(3,2);
+        answer << 
+            0,1,
+            0,1,
+            1,0;
+
+        REQUIRE (I == answer);
+    }
+
+
+
+}

tutorial/101_FileIO/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core tutorials)

tutorial/102_DrawMesh/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/103_Events/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/104_Colors/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/105_Overlays/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw igl::opengl_glfw_imgui tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw igl::opengl_glfw_imgui tutorials)

tutorial/106_ViewerMenu/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw igl::opengl_glfw_imgui tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw igl::opengl_glfw_imgui tutorials)

tutorial/107_MultipleMeshes/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/108_MultipleViews/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/109_ImGuizmo/CMakeLists.txt

@@ -2,5 +2,5 @@ get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
 set(IMGUIZMO_PATH ${LIBIGL_SOURCE_DIR}/igl/opengl/glfw/imgui/imguizmo)
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries( ${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw igl::opengl_glfw_imgui tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries( ${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw igl::opengl_glfw_imgui tutorials)

tutorial/201_Normals/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
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 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/202_GaussianCurvature/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
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 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/203_CurvatureDirections/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
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 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/204_Gradient/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
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-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
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+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/205_Laplacian/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
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 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
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tutorial/206_GeodesicDistance/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
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-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
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+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/301_Slice/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
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+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/302_Sort/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
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+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/303_LaplaceEquation/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
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+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/304_LinearEqualityConstraints/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
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+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/305_QuadraticProgramming/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
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+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/306_EigenDecomposition/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
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 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/401_BiharmonicDeformation/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
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-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/402_PolyharmonicDeformation/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
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-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/403_BoundedBiharmonicWeights/CMakeLists.txt

@@ -1,8 +1,8 @@
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 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
 if(TARGET igl::mosek)
-  target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::mosek)
+  target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::mosek)
 endif()

tutorial/404_DualQuaternionSkinning/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
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 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/405_AsRigidAsPossible/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/406_FastAutomaticSkinningTransformations/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/407_BiharmonicCoordinates/CMakeLists.txt

@@ -1,6 +1,6 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
 

tutorial/408_DirectDeltaMush/CMakeLists.txt

@@ -1,6 +1,6 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
 

tutorial/501_HarmonicParam/CMakeLists.txt

@@ -1,6 +1,6 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
 

tutorial/502_LSCMParam/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/503_ARAPParam/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/504_NRosyDesign/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw igl::comiso tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw igl::comiso tutorials)

tutorial/505_MIQ/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw igl::comiso tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw igl::comiso tutorials)

tutorial/506_FrameField/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw igl::comiso tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw igl::comiso tutorials)

tutorial/507_Planarization/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/601_Serialization/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw igl::xml tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw igl::xml tutorials)

tutorial/602_Matlab/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw igl::matlab tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw igl::matlab tutorials)

tutorial/604_Triangle/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw igl::triangle tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw igl::triangle tutorials)

tutorial/605_Tetgen/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw igl::tetgen tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw igl::tetgen tutorials)

tutorial/606_AmbientOcclusion/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw igl::embree tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw igl::embree tutorials)

tutorial/607_ScreenCapture/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw igl::png tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw igl::png tutorials)

tutorial/609_Boolean/CMakeLists.txt

@@ -1,6 +1,6 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::cgal igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
-igl_copy_cgal_dll(${PROJECT_NAME}_bin)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::cgal igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+igl_copy_cgal_dll(${PROJECT_NAME})

tutorial/610_CSGTree/CMakeLists.txt

@@ -1,6 +1,6 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::cgal igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
-igl_copy_cgal_dll(${PROJECT_NAME}_bin)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::cgal igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+igl_copy_cgal_dll(${PROJECT_NAME})

tutorial/701_Statistics/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/702_WindingNumber/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/703_Decimation/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/704_SignedDistance/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/705_MarchingCubes/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/706_FacetOrientation/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw igl::embree tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw igl::embree tutorials)

tutorial/707_SweptVolume/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/708_Picking/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/709_SLIM/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/710_SCAF/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw igl::triangle tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw igl::triangle tutorials)

tutorial/711_Subdivision/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/712_DataSmoothing/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/713_ShapeUp/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/714_MarchingTets/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw igl::tetgen tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw igl::tetgen tutorials)

tutorial/715_MeshImplicitFunction/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/716_HeatGeodesics/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/717_FastWindingNumber/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw igl::cgal tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw igl::cgal tutorials)

tutorial/718_IterativeClosestPoint/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/719_ExplodedView/CMakeLists.txt

@@ -1,5 +1,5 @@
 get_filename_component(PROJECT_NAME ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR} NAME)
 project(${PROJECT_NAME})
 
-add_executable(${PROJECT_NAME}_bin main.cpp)
-target_link_libraries(${PROJECT_NAME}_bin igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)
+add_executable(${PROJECT_NAME} main.cpp)
+target_link_libraries(${PROJECT_NAME} igl::core igl::opengl igl::opengl_glfw tutorials)

tutorial/CMakeLists.txt

@@ -22,7 +22,7 @@ if(MSVC)
   set(CMAKE_RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY_DEBUG ${CMAKE_BINARY_DIR})
   set(CMAKE_RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY_RELEASE ${CMAKE_BINARY_DIR})
 else()
-  set(CMAKE_RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY "../")
+  set(CMAKE_RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY "${CMAKE_BINARY_DIR}/bin")
 endif()
 
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